NORex je extraktor dat z zdravotnické dokumentace, a následného exportu do NOR (Národního onkologického registru) a do FHIR databáze.
Manuální získávání dat z onkologických zpráv a jejich přepisování do národních registrů představuje pro zdravotnický personál administrativní zátěž. NORex tento proces automatizuje. Systém z nestrukturovaných lékařských zpráv (propouštěcí zprávy, patologie) extrahuje klíčové klinické parametry (MKN-10, TNM klasifikaci, morfologii, biomarkery) a předkládá je lékaři ke kontrole na jedno kliknutí, přičemž každou hodnotu podkládá přesnou citací ze zdrojového textu.
Technologická architektura a nástroje:
O přesné strukturované zpracování textu se zatím stará model gpt-6-astra v prostředí Azure OpenAI.
Backend využívá InterSystems IRIS for Health s běžícím HL7 FHIR R4 serverem. Využívá vektorové vyhledávání (Vector Search) pro sémantické dohledávání a propojování s databází MKN-10, kterou jsme si naimplementovali.
Dvoupanelová aplikace v Streamlit (běžící v rámci PoC na localhostu) zobrazuje vlevo originální zprávu a vpravo předvyplněný formulář. Po kontrole lékařem se zvalidovaná data odesílají přímo do FHIR databáze a zapisují do InterSystem databáze v originálním NOR formátu.
Vize do budoucna:
Privátní On-Premise model (Fine-Tuning): Pro reálné nasazení v nemocnicích plánujeme využití syntetických dat vygenerovaných velkým modelem k doladění (fine-tuning) menšího privátního open-source modelu. To zajistí ochranu soukromí pacientů (data neopustí nemocnici), výrazné snížení provozních nákladů a odstraní nutnost anonymizovat data.
Univerzální eHealth standard: Architekturu lze snadno rozšířit z onkologie na jakékoliv jiné lékařské zprávy (radiologie, epikrízy), čímž NORex otevírá cestu k celkovému sjednocení a digitalizaci lékařské komunikace. Stačí jen model rozšířit o lékařské pojmy v dané oblasti.
- Měli už předtím
- nic
- Využití AI
- Využívám ChatGPT-Astra pro extrakci dat a porozumnění kontextu zprávy. Přikládaná lékařská dokumentace je ale velmi malá, a proto spotřebovaných tokenů je velice málo.
- Dopad
- Projekt NORex primárně odstraňuje jednu z největších zátěží současné onkologie: rutinní administrativu. Jeho dopad se přímo projevuje na denní praxi personálu i na celkové digitalizaci nemocnice. Snažili jsme se aby nástroj byl co nejvíce přehledný a použitelný pro uživatele.
- Komu pomůže
- Lékaři a sestry, Nemocnice a poskytovatelé péče
- Technologie InterSystems
- Ano — V projektu NORex slouží InterSystems IRIS k uložení dat do standardizované FHIR databáze a současně hostuje dvě dedikované databáze pro finální formát NOR a číselník MKN-10. Nad MKN-10 databází navíc běží integrované Vector Search, který po identifikaci kódu v textu automaticky vyhledá a přiřadí zbývající související diagnostická data.
- Tým
- Los Kozlos — Daniel Kozel, Marek Kozel, Jakub Šotkovský
- Výzva
- AI NOR · Ostrava